入職一個月提意見引發的離職想不通？

以下是我入職一家公司一個月的遭遇，做爲我自己我已做出了自己本職內和以外的工作了，沒有聽到同事和人事的負面評價，但結果還是被公司部門經理考慮是否離職，請大家幫忙分析一下。
先說一下我的組長：
.20的SVN掛了一天我三次都不管，第一次我說掛了他說讓我檢.3那臺機器的，我檢了.3的發現版本根本對不上，後來又問他他說是的，又讓我檢.20，我說.20掛了，就這樣折騰了一天。
週六說讓我改需求，說怕給刪多了讓我另建一個文檔來改然後同樣加到SVN上，週一就說當時是讓我在原基礎上來改，不承認週六說的。
修改一條數據修改不了他說先刪再增加一條同樣的數據；
天天早會能開個三十分鐘以上，會議內容主要是讓大家說爲什麼沒完成，以及什麼時間完成，之後在黑板上寫一些大家看不懂的很高深的概念；
讓大家一週至少三天加班到九點以上，週六也加；
天天讓你自己估算能不能完成，
遇到困難不給解決或說些東西不着邊際的話，自己本地環境都跑不起來說別人沒有提交。
我們組一共五個人，我一個JAVA，一個做基本分析（PHP很熟），一個PHP，兩個實習生，再加上他一個小組長；兩個實習生的技術問題基本是我帶的，所有組員都很鬱悶，項目沒有進展，工程上到處都是紅叉，業務問題大家都解決不掉；我自從寫了一個公共調用第三方API的功能後，就被東一頭西一頭的指揮着；管理上基本的環境也沒法保障，出了問題一會讓連.12，一會讓連.18，不打招呼隨意清庫，隨意更換版本等等，公開說可能要和兩個實習生解約，實習生不敢言，老員工也不說話，因爲人家有合同嘛。
相信這樣的情況大家明白了吧？

我想我的組長在LINUX方面可能很厲害，但至少這個項目他帶不到哪裏去，其他部門的人對他不滿意，組內也對他不滿意，他基本上是處於一種裏外不得好的情況，我是一個剛來的，這樣的情況到九月底交不了工的時候我就得走了，也是爲了項目的進展順暢，所以我想我必須得反映一下。
我沒有找部門老總反映，級別太高了也不合適，我根本無意得罪我們組長，我只是想把流程上的事說說，希望能理順相關流程上的關係，這樣做起事來於私於組員於公司都是好事，於是我想到我初次面試的面試官（因爲雖說我在這組，但中午吃飯的時候還是和他一起，並且他歸我們部門老總管理，不會傳到別的'部門去，能力在部門裏也比較高）。
我初次面試的面試官也是項目經理，而我卻沒能分到他的組下，而是分到了剛纔的那個人的組裏。
講給了剛纔那個剛面試我的那個項目經理，他說這問題是很嚴重，找部門老總說說，我說這不合適吧，他說正常反映問題，公司不會因爲這個對你有想法的，結果部門老總把我找去，我把事情原封不動的說了，說完後部門老總說我抱怨太多，沒有替組長分憂（組長的情況前面說了，大家說兩個月之內就是再分憂也沒用呀，我的工作也特別多，更何況這些情況我都已經提醒過組長，我就是一個剛入職的員工），說我不適合公司這種單打獨鬥個人英雄主義，適合在流程規範化的大公司，並且有一個好領導，建議我考慮一下。(這裏特別註明一下我沒有直接找部門老總，部門老總說如果我直接找他就是越級了，找面試我的項目經理就對了，我慶幸我找了那個面試我的項目經理)
我回來的路上覺得他說的也是，也許我真不適合吧，再說老總這麼說了也說明他對我沒什麼意思，昨天早上就提了離職，昨天下午那個部門老總把我們組長給撤了，由老總親自掛帥，說到十月份這段時間裏項目由他負責，並且讓那組長只負責需求（還是和另外新調進組的兩個人一起），早會取消，加班在完成任務的情況下取消，加強培訓，明確分工等等，基本上都是我提出問題的解決方案，我談話時他也問我如果是我我怎麼辦，反正現在關係是理清楚了。
這樣的變化一方面即像把那組長邊緣化，又像是保護他，另一方面他親自負責也沒有讓另外項目經理插進來替換組長。我回來越想越不對勁，感覺裏面像是很多事，我無論是幹好還是幹不好都是承擔責任的那一個人。
部門老總不可能不知道情況，他是想找一個合適的理由邊緣化那個組長，還是想找一個理由把我招進來爲那組長當替死鬼，我覺得都有可能，這個組如果組長繼續幹下去肯定是完不成任務的，那麼我唯一一個做JAVA的肯定承擔責任在前；如果我中途提出來那麼他把我和組長幹掉也有一個正道的理由。部門老總與我談話時表面上這麼說我適合大公司看似有他的道理，我當時也覺得像部門老總說的一樣自己不適合單打獨鬥的項目組，但現在我回想起來我這麼努力的工作難道還不適合公司嗎？雖說我說的有點過，但我總覺得裏面有些什麼事。
然後包括人事的，還有周圍別的同事對我工作和人也很認同，說我還可以考慮留下來。
好了，話就到這了，自己這一個月很累，大家有時間幫我分析一下這個情況吧。以下是我入職一家公司一個月的遭遇，做爲我自己我已做出了自己本職內和以外的工作了，沒有聽到同事和人事的負面評價，但結果還是被公司部門經理考慮是否離職，請大家幫忙分析一下。
先說一下我的組長：
.20的SVN掛了一天我三次都不管，第一次我說掛了他說讓我檢.3那臺機器的，我檢了.3的發現版本根本對不上，後來又問他他說是的，又讓我檢.20，我說.20掛了，就這樣折騰了一天。
週六說讓我改需求，說怕給刪多了讓我另建一個文檔來改然後同樣加到SVN上，週一就說當時是讓我在原基礎上來改，不承認週六說的。
修改一條數據修改不了他說先刪再增加一條同樣的數據；
天天早會能開個三十分鐘以上，會議內容主要是讓大家說爲什麼沒完成，以及什麼時間完成，之後在黑板上寫一些大家看不懂的很高深的概念；
讓大家一週至少三天加班到九點以上，週六也加；
天天讓你自己估算能不能完成，
遇到困難不給解決或說些東西不着邊際的話，自己本地環境都跑不起來說別人沒有提交。
我們組一共五個人，我一個JAVA，一個做基本分析（PHP很熟），一個PHP，兩個實習生，再加上他一個小組長；兩個實習生的技術問題基本是我帶的，所有組員都很鬱悶，項目沒有進展，工程上到處都是紅叉，業務問題大家都解決不掉；我自從寫了一個公共調用第三方API的功能後，就被東一頭西一頭的指揮着；管理上基本的環境也沒法保障，出了問題一會讓連.12，一會讓連.18，不打招呼隨意清庫，隨意更換版本等等，公開說可能要和兩個實習生解約，實習生不敢言，老員工也不說話，因爲人家有合同嘛。
相信這樣的情況大家明白了吧？

我想我的組長在LINUX方面可能很厲害，但至少這個項目他帶不到哪裏去，其他部門的人對他…