三方協議與勞動合同

用人單位與學校、在校學生簽訂的三方協議中，用人單位給學校提供一定的科研資金，給學生提供學費等資金，並規定學生畢業後到用人單位須工作滿一定年限，並就該工作年限約定了違約金，另外規定了工作崗位、薪資福利待遇等。學生在畢業前，還不具備勞動者的主體資格身份，因此這份三方協議應當不是勞動合同。那學生畢業後，其與用人單位簽訂了勞動合同，其中合同期限有所調整（縮短了用工期限），問題是：前一份三方協議對於用人單位和這位勞動者（以前的學生）是否仍具備效力？我覺得學生畢業後的'勞動合同已經取代了該三方協議，關於工作年限，應以勞動合同約定的爲準。各位法律人士的看法是怎麼樣的？