月中離職，怎麼算工資？

10月中旬離職，辭職報告由於部門疏忽沒有上繳，由於要離職證明，在11月初才得知。人事讓我返還10月多出來的'工資。請問工資和公積金等怎麼算？例如一個月工資是3600。（公司算的要還給公司2200左右）個人所得稅也要我自己承擔麼？如果是半個月的工資不存在個人所得稅吧？